L’Association Régionale pour le Travail Social est issue des 2 associations qui géraient l’institut de formation d’éducateurs spécialisés et l’institut de service social. Elle a mis en place des transversalités dans la formation des professionnels et obtenu la création de l’IRTS. Ses membres de droit sont :

- le Conseil régional de Franche-Comté,
- les Conseils généraux de Franche-Comté,
- le Conseil Economique et Social de Franche- Comté,
- l’Université de Franche-Comté,
- les organismes et collectivités de l’action sociale.

Sa mission est de gérer l’IRTS de Franche-Comté, d'assurer sa mission de service public, de contribuer à la recherche et à l’animation dans les milieux professionnels de l’action sociale.